发展村集体经济面临的困难主要有
1.公众舆论仍然对集体经济有偏见。近年来，我国学术界有一种否定集体经济的氛围。有的学者夸大了刘庄、南街、华西等典型集体经济村的特殊性，忽视了这种特殊性背后的历史必然性和普遍性；有学者否定中国农业合作化进程的合理性，认为中国没有集体化，只有“集体化”，直接为土地私有化铺路。在他们看来，农村集体经济不仅低效落后，而且不人道，是腐败和村霸的“温床”。这些认识的根源在于:第一，由于各地生产力发展不平衡，我国农村改革发展过程中确实存在不少问题，特别是一些集体经济的“空壳村”，问题更为严重。在反思这些问题时，有些人首先有意无意地把集体经济当成罪魁祸首，根本不去思考集体经济弱化所带来的更严重的问题。二是绝对片面地看待公有制经济和非公有制经济的关系，统分结合的双层经营体制中分散的家庭经营和统一的集体经营的关系，以及一部分人先富起来和* * *同富的关系，没有看到两者之间的对立统一。所以，他们看不到或者无视集体经济的先进模式。他们一提到集体经济，马上就把它等同于产权不清、效率低下、管理不善。他们看不到改革开放为农村集体经济逐步发展所准备的物质基础，也忽视了广大农民对集体经济发展的根本愿望，不顾现实一味强调私有化的改革方向。在他们看来，谁强调发展集体经济，谁就是极左，不解放。
2.一些地方对农村集体经济发展还缺乏相应的政策支持。在集体经济保守落后的不利舆论影响下，一些地方缺乏发展集体经济的宽松政策环境，造成集体经济贷款难、税负重等问题。一些改革政策措施难以落实，党的方针政策流于形式。
3.农村基层党组织建设有待加强。农村集体经济的发展壮大，离不开技术过硬、作风优良的领导和强有力的农村基层党组织。早在1987年，中共中央就下发了《关于深化农村改革的通知》，要求农村党支部、村民委员会、合作组织的干部都是有事业心、有开拓精神、办事公道、能带领群众致富的人。在集体经济实力薄弱的农村，党员年龄偏高，文化程度偏低，党员干部队伍不稳定，党组织的凝聚力、号召力和战斗力不强。农村基层党组织特别是村级党组织建设已成为制约大多数农村集体经济组织发展的“瓶颈”。因此，加强党的农村基层组织建设，加强党对农村工作的领导，已成为迫切要求。
4.集体主义观念弱化了。集体主义是社会主义核心价值体系的重要组成部分，是集体经济的灵魂。由于千百年来小农经济的深刻影响，以及小农长期艰苦的思想改造，在社会主义初级阶段的条件下，农民仍然不可避免地保存着旧社会的一些思想和习惯。一些地方“分而不统”、“重分轻统”的做法，削弱了广大农民多年来形成的集体主义精神。
5.人才短缺问题没有得到根本改善。人才的引进和培养已经成为农村集体经济组织面临的一大难题。绝大多数农村集体经济组织既缺乏懂现代经济管理的人才，也缺乏农村经济发展急需的科技人才。一些村级集体经济组织存在决策不科学、创业观念淡薄、挥霍集体积累、无视集体财产流失、无视市场经济规律、产品科技附加值低、竞争力弱等现象。面对这些问题，农村集体经济组织成员表现出更多的无奈。